Entrepreneurship in the territories: is it the right time?
Avec ses 800 services hospitaliers couvrant 84 spécialités et avec plus de 4 000 projets de recherche en cours, l’AP-HP est une institution reconnue dans le monde médical pour la qualité et la compétence de ses professionnels de santé, exerçant dans nos 39 hôpitaux.
Travailler à l’AP-HP c’est poursuivre un intérêt général dans un grand service public et venir en appui nos 100 000 professionnels pour que soit assurée la meilleure prise en charge possible des 10 millions de patients par an qui sont accueillis dans nos hôpitaux.
L’AP-HP est le 1er Groupe Hospitalo-Universitaire européen et fait partie des 3 plus importants groupes hospitaliers mondiaux.
Nos équipes participent directement à l’effort de consolidation de ce haut niveau d’excellence médicale. Pour cela, chaque collaborateur de la Direction des Systèmes d’Information de l’AP-HP s’engage à :
- s’investir quotidiennement pour atteindre ses objectifs placer son intégrité et celle de l’institution au premier plan,
- travailler en équipe,
- fournir le meilleur service pour nos utilisateurs finaux qu’ils soient professionnel de santé ou patient,
- faire preuve de diplomatie en toute circonstance,
- respecter sans condition les règles de confidentialité inhérentes à nos activités.
La Direction des Systèmes d’Information :
- Intègre des logiciels/progiciels,
- Développe des applications,
- Teste et qualifie des produits,
- Développe des méthodes et outils de traitement de données massives,
- Construit des architectures et assure une urbanisation optimale des applications informatiques,
- Pilote des infrastructures complexes : serveurs, stockage, réseaux de haute performance.
Ce que vous ferez dans notre équipe contribuera directement au bon fonctionnement de l’AP-HP pour assurer notre Priorité N°1 : fournir le meilleur service à nos patients et nos professionnels !
« Je ne peux pas vous dire, on manque de données là-dessus ». Cette question, quiconque a été pris en charge pour une maladie un peu complexe l’a entendu en consultation. Dans les maladies rares, qui concernent 3 millions de personnes en France selon le Ministère de la Santé, il peut y avoir une incertitude sur le devenir à quelques mois, quelques années, les risques en matière d’hérédité, l’efficacité d’un médicament, etc. Autant dire que cette phrase, on l’entend beaucoup.
C’est justement pour contribuer à l’exploitation de la Banque Nationale de Données Maladies Rares que nous ouvrons aujourd’hui deux postes de data scientist en CDI. Au sein de notre équipe pluridisciplinaire de 20 personnes, dont 1/3 dédiées aux data, travaillant main-dans-la-main avec les médecins experts des 6000 maladies rares dont nous recensons les sujets, s’appuyant sur une infrastructure dédiée adaptée à la data science (nœud GPU, JupyterLab), ces deux nouveaux recrutés auront directement en charge de grands projets nationaux en épidémiologie et en santé publique.
Ces enjeux vous interpellent, vous êtes à l’aise avec un clavier et vous appréciez le travail d’équipe : envoyez-nous votre CV et lettre de motivation.
Missions
• Mettre en place et industrialiser les règles de contrôle qualité des données de l’entrepôt selon les spécifications formalisées par la référente qualité et/ou les demandes des Filières de Santé Maladies Rares. Les contrôles seront de différents niveaux : patients, site de soins, établissements, … ;
• Aider à l’amélioration continue des spécifications par l’identification de nouveaux scénarios de qualité en utilisant des méthodes exploratoires plus globales sur toute la base ou par groupements thématiques ;
• Extraire et préparer les cohortes selon les protocoles de recherche et analyser la qualité et les déviations ;
• Réaliser des fouilles exploratoires dans de grandes bases de données publiques ou à accès contrôlé comme le SNDS (PMSI, SNIIRAM, …) ;
• Prendre en charge les analyses statistiques en lien avec des projets internes ou en partenariat avec des laboratoires publics/privés ; et
• Former à rythme d’au moins 1h tous les deux mois des utilisateurs de BaMaRa et des investigateurs de la BNDMR, en même temps que la formation aux chargés de mission des FSMR et des Plateforme d’Expertise MR (PEMR).
Compétences requises
• Excellente maîtrise des outils d’analyse de données (R et/ou Python)
• Maîtrise indispensable des systèmes de gestion des bases de données relationnelles (SGBDR PostgreSQL) ; une expérience avec un SGBD NoSQL (MongoDB) serait un plus
• Connaissance d’un des outils de versionning et du travail collaboratif (Gitlab, GitHub, …)
• Expérience en techniques de data management (manipulation de plusieurs sources, chainage, typage automatique des variables, gestion des libellés, bibliothèque de formats, sous-populations, gestion des données manquantes …)
• Maitrise des méthodes statistiques appliquées aux sciences de la vie (descriptives, univariées, multivariées, régression linéaire, régression logistique, modèles de survie, …)
• La connaissance des bases de données du SNDS (SNIIRAM, PMSI, EGB …) serait très appréciable
• Bon niveau d’anglais (oral et écrit)
Connaissances associées
• Intérêt pour les études épidémiologiques
• Curiosité et goût pour le traitement des données des bases de données de grandes dimensions
• Sensibilité aux pratiques régies par le RGPD et des orientations et doctrines CNIL sur la protection des données de santé
Qualités requises
• Qualité de pédagogie (expérience avérée de formateur, à minima ponctuel)
• Sens de l’écoute et du service d’utilisateur parfois non-expert des données de santé
• Aptitude à travailler en équipe, à s’adapter aux contraintes
• Sens de l’organisation, rigueur et respect des délais
• Confidentialité : soumis au secret professionnel dans le cadre des données à gérer
